20世纪中叶，地球遭遇了名为“伯劳”的外星生物入侵。
它们的形态类似于地球上的鸟类，但体积却要庞大许多。这些生物带来了它们的整个生态系统，以纳米机械和有机体的嵌合为基础，逐步占据地球，并侵占整个生态圈。
人类随即应战。
第一场伯劳战争持续了数年时间，起初伯劳取得了极大的优势，后来，人类开发出可以匹敌伯劳的“尖刀”战斗系统，将战线一度反推回去。
在伯劳的领袖更替后，双方开始议和，在亚欧大陆以淮河-青藏高原-中东为界，，在美洲以巴拿马运河为界，伯劳占据了亚洲北部和美洲南部，人类取得了暂时的和平。
在休养生息的这段时间里，伯劳和人类都在积极备战，向对方的阵营派遣间谍和密探，为下一轮的战争做好准备。
《荆棘的双翼》故事开始于停火协议签署六年后。
随着人类一方的准备完成、以及伯劳族群的进一步分裂，战争的阴云越发迫近，并以比枪炮更残酷的方式打响了第一仗。
为了拯救伯劳，白英不得不面对她试图掩埋的过去——那令她背叛人类投向异族的理由。而为了保卫人类，秦锐则决定成为比伯劳更强的怪物，来对抗伯劳。而伯劳们也将面对彼此。
在北方大陆的战场上，一场决定伯劳命运的战斗由一名人类的叛徒带头打响。但他们却不得不面对意料之外的敌人……